当时，陈懋无无法判断是不是所有日寇都已经投降，所以还专程派人送去了一批资。在收缴了这些日寇的武，将其统一看押起来之后，让日寇饱餐了几顿，也浪费了一些粮。然后，再找几个没有多少戒心的日寇军官，去将那些躲在岛上腹地的日寇都找来。

同样的，九州，四国两地也是日本重要的粮产地，是因为这两地位置比较靠南，气候更温一些，而且沿海平原也不少，有大量适合耕的沃土地。可以说，了织田信长的老家尾张之外，九州与四国是日本最富庶的地方。当时，织田信长放弃了东夺取关东平原的机会，而是南下攻九州与四国，也正是看到了这一好。

当日寇发现气氛不对的时候，已经太晚了。当天晚上，明军在中下了毒，大分日寇都被毒死，一些警惕较，没有急着吃饭的日寇虽然没有被毒死，不过等待着他们的结果是一样。在天黑之后一个时辰，所有日寇都完了。当天晚上，明军连夜清扫屠杀现场，本来所有的尸都准备掩埋的，可是尸太多，本就埋不完，而且明军还要留下力在日本本土登陆。到最后，不得不将没有来得及掩埋的尸全都抛了大海。也正是如此，后来日本人才会记载明军在壹歧岛大屠杀的事情，当然，明帝国的正史中绝不会记载这样的事情，而是说这些日寇都是负隅顽抗，最终被消灭的！

这一招确实收到了效果，三日之内，近两千名躲在岛上的日寇见到明军没有杀害他们的意图（此时，严广儒还没有在对岛上大开杀戒呢），而且还优待俘虏，加上一个个也饿得不行了，就脆都放下了武，主动向明军投降了。

打下了壹歧岛之后，第一军团在岛上休整了两日，一方面是士卒长途跋涉，都非常的疲惫。而且很多陆军官兵不适合海上航行，现了严重的船现象，到了壹歧岛。很多人都被折磨得没有一人样了。另外，当时大批的运输船已经运回了釜山港，准备将更多的资运送到对岛，好支持明军的攻行动，没有足够的船只将登上壹歧岛的第一集团军运到日本本土去。

当时，日本的主要港都集中在西地区，特别是以长崎为中心的九州岛，一直是日本海上贸易发展得最为迅猛的地方。小西家族就是长崎的大商人家族，是日本最名的商业家族。而在九州岛，四国岛，以及本州岛之间的濑内海更是日本航海业最发达的地区，集中了大量的港。

显然，九州与四国对西军来说是非常重要的，这也是为什么朱祁钰要分兵两路，让陈懋率陆军主力攻九州的原因。只要打下九州，那就相

陈懋也不得不下令在这里暂时停了下来。不过，李舜臣指挥的西面舰队就没有歇着。而是趁第一集团军在岛上休整的机会，迅速率领舰队南下，杀向了日寇本土港。

召集到了南面的小港附近，然后集向明军投降了。

等到这些俘虏都被看了起来之后，邓茂的第一军对整个壹歧岛扫了一遍，将最后一些还没有投降的日寇铲除了之后，第一军撤到了港，而陈豫的第二军则已经将日寇给围了起来，卫平的第三军则在加快速度署，巩固第二军的防线。

而织田信长以霹雳手段征服了日本西地区之后。九州，四国两地都成了西军的大后方。当时，日寇使用的火，除了战前从明帝国购买的之外，大分都是靠商人从南洋买回来的。明帝国到南洋的火远比到日本的多。而很多南洋国家见到日本商人千里迢迢地赶到他们这边来买火枪，也立即看准了这个机会，起了二贩来。

当时，日本九州，四国与本州三岛之间的通完全依靠海上航线。