据计划，新一军建国，新二军倪守，新三军贾充组成一兵团，由倪守任兵团长，庐州攻河南后，打击驻防郑州的僧格林沁；九江的李秀成、皖中的韦志俊和从江西返回的杨辅清组成二兵团，由李秀成任兵团长，从六安北上，直取蒙城，打击在皖清军；新四军潘启亮，新五军冯天，新六军伏波组成三兵团，由潘启亮任兵团长，徐州击败山东巡抚李惠后直扑济南，而为奇兵的新十一军武智久和新十二军王仁甫待清军主力被引到河南、山东的时候，在上海登船沿海路攻取秦皇岛，并拿下山海关，太平师将为他们提供支援；整个战役的预备队由新七军陈平安，新八军郑伯，新十军史大担任；江**师及皖南防军控制九江，严防湘军异动；新九军焦富驻防天京，保卫天朝都城安全。取了太平师密事件的教训，担任攻击山海关的奇兵队除了王财和总参谋的少数几个人知他们的真正用之外，对外一律宣称是北伐战役的预备队，以此来掩人耳目，确保突袭计划的顺利。

之所以把李秀成、韦志俊、杨辅清的队调到安徽战场，王财是有私心的，因为从情报上来看，无疑清军在安徽的实力最，借清军之手削弱这些天朝旧臣的兵力，在他看来真正是一二鸟的好计策，虽然李秀成烧了洪秀全的密诏，但留着这些人在，他到底还是不放心。

同时为了合这次大规模的北伐，从人心士气上打击正面清军，加快战役程，减少队损失，舆宣司的几个老先生还写了一篇檄文（檄文不计正文字数，赠送）：“昔我黄帝，始建中华，尧舜禹汤，孔孟圣教，则文化彬彬，独步宇内，煌煌史册，逾五千年，宽仁博大，久著民德。奈胡元猾夏，窃号神州，华服变满装，汉音改胡腔，豪杰留猪尾，英雄始纲常，又迭兴文狱，灭尽汉章，动诬谋逆，夷绝九族，国士引劲，英丧，腥风播四海，毒秽宸极，又纵贪官污吏，骄民膏，可怜女，哭泣旁，官以贿得，刑以钱免，豪杰绝望，英俊抑郁。长蛇封豕，搏噬无遗。遂使神明胄，降为舆台；锦绣江山，沦于左衽，肆其穷凶，窃据我都邑，乌乎痛哉！今天朝中兴东南，辅王义千岁，奋发有为，重整河山，驱除胡虏，恢复中华，五族和谐，共享太平，立纲陈纪，救济斯民，古人有言，炎炎之火，可焚昆冈。是以夏后一成，能复故国，楚人三，足以亡秦；况以中国之大，人民之众，爰举义旗，为天下倡。群贤霞蔚，多士云兴；一鼓功成，克有全土。此则我华厦先圣在天之灵实式以凭，而中兴之运可左券也。唯是新初建，庶事待兴，引企英豪，同襄治理。然后奖帅三军，会师北伐，饮长城；捣彼虏，歼其丑类。望天下耆艾、河朔健儿，岭表孤忠，中原旧曲，应此檄文，各整义师，振臂执锐，共讨胡贼，上顺天时，下安黎庶，以匡诸夏。若甘

霖在河南屠杀完捻军后也转回防颖州，山东巡抚李惠则在顾诗的严令下，率军二万重新推到了沂州，胜保的一万人布防兖州，而重新被启用的僧格林沁则率蒙古队坐阵郑州以为后援，五万新编练的主力新军则由顾诗亲自统领，驻防京、津一线，随时准备南下。

前期从江南各个战场赶回到苏南的十二支新军主力接到王财北伐动员令之后纷纷开始照总参谋的密令各个战役发地，加准备北伐所需的各资、弹药，辎务司从各地征调防军保护补给随军北上，整个江南都开始行动了起来，一时间战云密布，杀伐之气顿起。

与此同时，太平天国全境战时状态，实行连坐法，一人犯法，全家问斩，一犯法，十问罪，十万二线新军分布各地坐镇，严厉镇压任何敢于滋生事端和对抗官府的行为，安庆、苏州兵工厂日夜开工，加班生产军火，保证前线需要。同时为了确保曾国藩不至于铤而走险，王财密信已经打到贵州的翼王石达开阵兵贵、湘边界，监视湘军，曾国藩安心的待在两湖。

在北京的范例收集到这些情报后，上送回天京，王财意识到再拖延北伐的时间，的确能够让自己准备更充份一，但是也给清廷息之机，从而增加了军的难度，招来总参谋急商讨之后，他终于下定决心，发布总动员令，誓师北伐！