东、直隶、安徽、贵州等省，凡是有信奉天主教的人，以及传授天主教的西洋人，统统抓起来送到北京受审。随着一份份情况汇报送到京城，乾隆皇帝震惊了。原来在帝国多个省份的角落，都有隐藏的西洋鬼在传教，这远远超过自己当初的估计，现在看来绝不止4人，这些人可都是未经允许窜到内地的。愤怒的乾隆皇帝更加对广东官员失望，上下令全国各地秘密严查。

蔡伯多禄本来是福建人，真名叫住蔡鸣阜，信奉天主教后就改名了，这位爷一直在广东当江湖郎中，也属于崇洋媚外的汉，4名意大利传教士偷渡到广州，就是这位改掉父母所赐姓名的铁杆儿汉运作的。孙士毅的巡查队先抄了蔡伯多禄的家，他只有逃到另外一位信徒家里。1784年9月26日晚上，孙士毅带着军队抄了蔡伯多禄躲藏的教徒家。这位汉窗逃走，连夜乘船逃到了澳门。

澳门的牙人之前一直搪孙士毅，主要是牙驻澳门总督华利亚到果阿差去了。孙士毅的通牒下达后不久，华利亚就从果阿回到了澳门。华利亚对孙士毅的脾气秉不了解，所以态度非常地，就是决不蔡伯多禄，甚至还提一个侮辱大清帝国的理由：澳门当局不对中国逃亡者负责任，澳门是向所有人开放的，无法阻止逃亡者的境。

华利亚的激怒了孙士毅，孙士毅立即下令封锁澳门。

乾隆皇帝怒气冲天，一定要将蔡伯多禄抓捕归案。孙士毅掌握了蔡伯多禄的情报后，便派了两名官员到澳门要人。当时澳门的牙人本不知蔡伯多禄已经逃到澳门，对孙士毅派来的人说蔡伯多禄不在澳门。孙士毅不信邪，很快就找到了运送蔡伯多禄逃亡澳门的船夫，船夫称看到蔡伯多禄了澳门方济各修院。10月3日，孙士毅再派人到澳门索人，可是蔡伯多禄已经乔装打扮，藏到了奥古斯丁修院。

孙士毅的噩运来了。

孙士毅很快意识到，从正常的渠要想抓住蔡伯多禄基本不可能，牙人一定会想方设法阻挠。要想让牙人乖乖就范，那就要断了牙人的生路。孙士毅非常清楚，澳门的都是依靠广州供应，只要封锁澳门，牙人就会乖乖地蔡伯多禄以及其他的天主教徒。孙士毅立即又派官员到澳门，非常地警告牙人，如果不蔡伯多禄一人，广东就封锁澳门。

孙士毅接到乾隆皇帝旨意后，早已胆战心惊，意大利人就是从自己辖的地盘上发的，可以说是帝国教案的风暴源。孙士毅毫不手，将哆罗以及接送过意大利人的相关中国传教士一人全抓获。这一抓又让乾隆皇帝大吃一惊，在广东竟有上百人信奉天主教，可是特成额情况汇报中的关键人蔡伯多禄却神秘失踪了。

封锁澳门后，1784年10月26日，孙士毅给乾隆皇帝写了一份情况汇报。乾隆皇帝拿到汇报后，一看也就是一份简单的搜捕汇报。这份汇报的末尾，孙士毅写：窃思，西洋人来广贸易，寓居商人十三行内，该商分应稽查、约束，岂容内地民与之接。乃蔡伯多禄擅行招引，该商等置之不见不闻，一任改装越境，咎实难辞。

全国行动起来了，一些怪异的教徒也浮面，乾隆皇帝的臣、陕甘总督福康安抓的嫌疑犯一下增加到72人，这些天主教徒主要集中在甘肃、凉州二府，有些中国居民信奉了天主教后，甚至将父母所起的名字都给改了，其中有一位非常崇拜传教士多明我，也就是那位想方设法把澳门变成牙人的多明我，这位中国教民改名刘多明我。汉当到这份儿上也算铁杆儿了，连祖宗都能够背弃，乾隆皇帝能不害怕吗？

孙士毅为了推卸责任，将蔡伯多禄秘密帮助意大利传教士偷渡的责任，以及后来窜到内地的责任，统统推到了行商上，乾隆皇帝还没有老昏，特地在蔡伯多禄的名字后面朱批：“此人何尚未获？”通览孙士毅写给乾隆皇帝的汇报，除了汇报材料末尾有乾隆皇帝朱批的三个字“知了”之外