但是洪宣的政治能量还是存在的，她与天京事变的发生有重大的关系。杨秀清在太平天国发展前期功勋卓著，开始自恃功，最后发生了“封万岁”的事件。

洪宣想成为第三个，因此也模仿洪秀全的办法，升天了一回。谁想，洪宣这么打破了太平天国的政治格局，天王洪秀全和东王杨秀清都不承认洪宣有这样的能力。杨秀清借“天父下凡”狠狠地责打了她六十大板，天王还专门责骂洪宣“不遵天令言题”从此，洪宣在政治上消极了许多，不像之前那么情单纯了。

桂林、柳州湖南境内。战争异常惨烈，在蓑衣渡激战中，南王冯云山中炮而死；围攻长沙城时，西王萧朝贵又阵亡。新婚不久的洪宣成了寡妇。

据说，洪宣年少的时候曾经患病卧床不起，病得迷迷糊糊之间仿佛见到一位老人在召唤她，对她说：“十年以后，将会有一个人从东方来，教你如何拜上帝，你当真心顺从。”洪秀全发动太平天运动后，洪宣认定自己病中见到的就是上帝，自己有和上帝直接谈的能力。当时太平天国中只有两个人有这样的能力。一个是天王洪秀全本人，可以“升天”；一个是东王杨秀清，可以传递天父天兄的命令。

野史说洪宣挑拨哥哥发动天京事变是因为她“生”“善妒”他们说洪宣在萧朝贵死后与东王杨秀清私通。

天京后，杨秀清日益跋扈对洪宣渐渐疏远，反而迷恋上了新科女状元傅善祥。洪宣气愤不过就委于北王韦昌辉，鼓动天王和北王发动政变杀了杨秀清和傅善祥。据说事变当天，东王府里大摆筵席。洪宣等人都参加了。

洪宣当时就说服哥哥洪秀全除掉杨秀清。起初洪秀全不忍下手，说：“朕与他都是同生共死、患难与共的好兄弟，怎么能忍心下手？”洪宣则说：“如果天主一人不忍心，那么天国内人人都要忍受杨秀清的跋扈。”洪秀全这才有些心动，密召韦昌辉回天京，诛杀杨秀清，烧毁东王府。

洪宣在酒席上向韦昌辉使，韦昌辉刀杀了杨秀清。洪宣等人再依靠事先埋伏好的军队，将杨秀清一党铲除。这样说来，洪宣当是天京事变的重要参与者和执行者了。还有的笔记中甚至绘声绘地说杨秀清与傅善祥同房时被杀。事后洪宣东王府见到傅善祥血模糊的尸还恨恨地说“妖婢亦有今日”云云。这段记述见诸各类野史。

有一句话是怎么说来着，寡妇门前是非多，关于这洪宣就有各各样的故事传来了，比如说她的政治手腕，据说是不亚于武则天与慈禧的，洪宣在太平军中的主要事迹是理“女营”太平军起义之初准许大家携带家眷随营行动。为了便于理和行动，在洪宣的建议下，全女眷被集中起来，建立了“女营”洪宣任统领。到南京定都后，战争暂时停歇，于是将“女营”改为“女馆”依然由洪宣负责。